12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4094 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_4094  capsule biosynthesis phosphatase  100 
 
 		 126 aa  256  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.875104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3890  capsule biosynthesis phosphatase  98.41 
 
 		 133 aa  253  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2612  hypothetical protein  72 
 
 		 126 aa  201  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0108  hypothetical protein  66.39 
 
 		 124 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.930749  normal  0.0145062 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1802  capsule biosynthesis phosphatase  63.71 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0731  hypothetical protein  49.59 
 
 		 132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0422  hypothetical protein  46.34 
 
 		 156 aa  126  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1662  hypothetical protein  48.74 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0300  capsular polysaccharide biosynthesis protein  65.75 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0248181  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1341  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase-like  38.24 
 
 		 347 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00519164  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1347  phosphoheptose isomerase  36.63 
 
 		 302 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.19661  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1331  hypothetical protein  30.69 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0108039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>