12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0108 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0108  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  259  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.930749  normal  0.0145062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2612  hypothetical protein  76.61 
 
 		 126 aa  207  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4094  capsule biosynthesis phosphatase  66.39 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.875104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3890  capsule biosynthesis phosphatase  65.55 
 
 		 133 aa  180  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1802  capsule biosynthesis phosphatase  55.37 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0731  hypothetical protein  56.2 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0422  hypothetical protein  50.82 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1662  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0300  capsular polysaccharide biosynthesis protein  60 
 
 		 81 aa  106  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0248181  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1331  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0108039  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1341  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase-like  32 
 
 		 347 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00519164  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11063  hypothetical protein  23.42 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>