30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1462 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1462  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  356  8e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01542  hypothetical protein  83.73 
 
 		 166 aa  294  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003980  hypothetical protein  80.72 
 
 		 166 aa  282  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2183  hypothetical protein  74.7 
 
 		 166 aa  264  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2838  hypothetical protein  64.46 
 
 		 164 aa  229  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1362  YfbU family protein  64.46 
 
 		 164 aa  223  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.001186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02179  hypothetical protein  64.46 
 
 		 164 aa  223  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.515809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3433  hypothetical protein  64.46 
 
 		 164 aa  223  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0807439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2670  hypothetical protein  64.46 
 
 		 164 aa  223  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.572681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2449  hypothetical protein  64.46 
 
 		 164 aa  223  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.662556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1358  hypothetical protein  64.46 
 
 		 164 aa  223  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.783257  normal  0.145794 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02219  hypothetical protein  64.46 
 
 		 164 aa  223  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2563  hypothetical protein  64.46 
 
 		 179 aa  223  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2475  hypothetical protein  64.46 
 
 		 179 aa  223  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.682759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2683  hypothetical protein  64.46 
 
 		 179 aa  223  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.798312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2520  hypothetical protein  64.46 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2575  hypothetical protein  64.46 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2557  hypothetical protein  65.06 
 
 		 164 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2778  hypothetical protein  63.86 
 
 		 164 aa  220  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.669801  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1486  hypothetical protein  63.25 
 
 		 164 aa  220  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286121  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2587  hypothetical protein  63.86 
 
 		 164 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0140682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1387  hypothetical protein  63.25 
 
 		 164 aa  218  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00279413  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1445  hypothetical protein  60.24 
 
 		 164 aa  213  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1553  hypothetical protein  60.24 
 
 		 164 aa  213  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.926167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1823  hypothetical protein  60.24 
 
 		 164 aa  213  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3314  hypothetical protein  59.04 
 
 		 165 aa  206  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000296019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1656  hypothetical protein  45.73 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000094537  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4782  YfbU family protein  30.67 
 
 		 257 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0266017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5731  hypothetical protein  30.56 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08970  non-hypothetical protein  27.37 
 
 		 237 aa  41.6  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>