27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1656 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1656  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  340  2.9999999999999997e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000094537  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2475  hypothetical protein  49.38 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.682759  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2563  hypothetical protein  49.38 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211466  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2575  hypothetical protein  49.38 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2520  hypothetical protein  49.38 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2587  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0140682  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1362  YfbU family protein  49.38 
 
 
164 aa  195  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.001186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1387  hypothetical protein  51.23 
 
 
164 aa  195  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00279413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02179  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  195  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.515809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3433  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  195  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0807439  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2670  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  195  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.572681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2449  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  195  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.662556  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1358  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  195  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.783257  normal  0.145794 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02219  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  195  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2683  hypothetical protein  48.77 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.798312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1553  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.926167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1823  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1445  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2838  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  193  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2557  hypothetical protein  50.62 
 
 
164 aa  190  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1486  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  189  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2778  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  189  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.669801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3314  hypothetical protein  47.53 
 
 
165 aa  187  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000296019  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2183  hypothetical protein  46.95 
 
 
166 aa  163  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003980  hypothetical protein  46.34 
 
 
166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1462  hypothetical protein  45.73 
 
 
170 aa  153  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01542  hypothetical protein  43.29 
 
 
166 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>