28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2670 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1362  YfbU family protein  100 
 
 
164 aa  347  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.001186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02179  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  347  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.515809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3433  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  347  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0807439  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02219  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  347  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2670  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  347  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.572681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1358  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  347  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.783257  normal  0.145794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2449  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  347  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.662556  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2587  hypothetical protein  99.39 
 
 
164 aa  343  8e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0140682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2683  hypothetical protein  95.73 
 
 
179 aa  337  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.798312 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2475  hypothetical protein  95.73 
 
 
179 aa  337  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.682759  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2563  hypothetical protein  95.73 
 
 
179 aa  337  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211466  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2520  hypothetical protein  95.73 
 
 
179 aa  337  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2575  hypothetical protein  95.73 
 
 
179 aa  337  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2838  hypothetical protein  89.63 
 
 
164 aa  323  5e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2778  hypothetical protein  86.59 
 
 
164 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.669801  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1486  hypothetical protein  85.98 
 
 
164 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286121  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1553  hypothetical protein  80.49 
 
 
164 aa  296  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.926167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1823  hypothetical protein  80.49 
 
 
164 aa  296  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1445  hypothetical protein  80.49 
 
 
164 aa  296  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1387  hypothetical protein  80.49 
 
 
164 aa  290  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00279413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2557  hypothetical protein  81.1 
 
 
164 aa  288  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3314  hypothetical protein  77.44 
 
 
165 aa  281  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000296019  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1462  hypothetical protein  64.46 
 
 
170 aa  223  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01542  hypothetical protein  60.84 
 
 
166 aa  218  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003980  hypothetical protein  59.04 
 
 
166 aa  217  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2183  hypothetical protein  58.43 
 
 
166 aa  209  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1656  hypothetical protein  49.38 
 
 
162 aa  195  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000094537  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5731  hypothetical protein  27.54 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>