31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003980 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003980  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  348  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01542  hypothetical protein  92.17 
 
 
166 aa  327  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2183  hypothetical protein  81.33 
 
 
166 aa  287  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1462  hypothetical protein  80.72 
 
 
170 aa  282  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2838  hypothetical protein  58.43 
 
 
164 aa  218  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1387  hypothetical protein  62.05 
 
 
164 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00279413  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2683  hypothetical protein  59.04 
 
 
179 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.798312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2520  hypothetical protein  59.04 
 
 
179 aa  217  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2475  hypothetical protein  59.04 
 
 
179 aa  217  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.682759  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2563  hypothetical protein  59.04 
 
 
179 aa  217  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211466  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2575  hypothetical protein  59.04 
 
 
179 aa  217  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3433  hypothetical protein  59.04 
 
 
164 aa  217  7e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0807439  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1362  YfbU family protein  59.04 
 
 
164 aa  217  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.001186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02179  hypothetical protein  59.04 
 
 
164 aa  217  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.515809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02219  hypothetical protein  59.04 
 
 
164 aa  217  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2670  hypothetical protein  59.04 
 
 
164 aa  217  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.572681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2449  hypothetical protein  59.04 
 
 
164 aa  217  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.662556  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1358  hypothetical protein  59.04 
 
 
164 aa  217  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.783257  normal  0.145794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2557  hypothetical protein  60.84 
 
 
164 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2587  hypothetical protein  58.43 
 
 
164 aa  213  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0140682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1486  hypothetical protein  59.04 
 
 
164 aa  213  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2778  hypothetical protein  58.43 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.669801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1823  hypothetical protein  57.23 
 
 
164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1445  hypothetical protein  57.23 
 
 
164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1553  hypothetical protein  57.23 
 
 
164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.926167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3314  hypothetical protein  57.83 
 
 
165 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000296019  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1656  hypothetical protein  46.34 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000094537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08970  non-hypothetical protein  28.85 
 
 
237 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256677  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4782  YfbU family protein  32.56 
 
 
257 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0266017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5731  hypothetical protein  29.93 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2683  YfbU family protein  35.64 
 
 
255 aa  40.8  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00102024  hitchhiker  0.00753709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>