20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5731 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5731  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  364  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119524 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1462  hypothetical protein  30.56 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3262  YfbU family protein  24.75 
 
 
252 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0126504  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2838  hypothetical protein  28.74 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01542  hypothetical protein  30.61 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2520  hypothetical protein  27.54 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003980  hypothetical protein  29.93 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2683  hypothetical protein  27.54 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.798312 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2475  hypothetical protein  27.54 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.682759  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2563  hypothetical protein  27.54 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211466  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2575  hypothetical protein  27.54 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02219  hypothetical protein  27.54 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2670  hypothetical protein  27.54 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.572681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2449  hypothetical protein  27.54 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.662556  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1358  hypothetical protein  27.54 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.783257  normal  0.145794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3433  hypothetical protein  27.54 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0807439  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02179  hypothetical protein  27.54 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.515809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1362  YfbU family protein  27.54 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.001186  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2587  hypothetical protein  27.54 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0140682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2683  YfbU family protein  29.51 
 
 
255 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00102024  hitchhiker  0.00753709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>