29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0539 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0539  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04900  hypothetical protein  48.18 
 
 
278 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000748  hypothetical protein  45.21 
 
 
280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.852715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  25 
 
 
172 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  30.43 
 
 
264 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  26.32 
 
 
192 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  26.32 
 
 
192 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  32.03 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  32 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  26.61 
 
 
257 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  24.81 
 
 
194 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  26.61 
 
 
257 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  31.45 
 
 
258 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  29.51 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  29.37 
 
 
280 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  31.4 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  27.5 
 
 
262 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  27.2 
 
 
185 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  28 
 
 
185 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  28 
 
 
185 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  28 
 
 
185 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  28 
 
 
185 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>