49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0015 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6029  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.065223  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0026  tRNA-Gly  84.85 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0016  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0033  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0044  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000110049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5102  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000061566  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0043  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0047  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0122655  normal  0.0125348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0107  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000460652  hitchhiker  0.00217641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1180  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000995593  hitchhiker  0.000000000000787361 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4426  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  hitchhiker  0.0000476038 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0698  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00121364  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4695  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.29308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4476  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000038079  hitchhiker  0.00000000000000785716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4473  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000778472  hitchhiker  0.000364054 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4354  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000304012  normal  0.98071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4386  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000113588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4550  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000345033  hitchhiker  0.00000000000121992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5443  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000114766  hitchhiker  0.00132893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0053  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000151036  normal  0.932555 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna050  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna007  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0012  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0092  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t007  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0065  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0034  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.530843  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly01  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0014  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000252588  normal  0.0241581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0014  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000837111  hitchhiker  0.00969138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0014  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323957  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0012  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471876  hitchhiker  0.000087686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0031  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.754836  normal  0.341264 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4719  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20782e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0035  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.072829  normal  0.169297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0013  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000316853  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0031  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0030  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0045  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0005  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000491266  normal  0.390681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0125  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0490  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.826084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2721  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00076  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000423625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>