55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_R0053 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000151036  normal  0.932555 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14070  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28400  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0941347 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0062  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.588176  normal  0.0646028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0045  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.356708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0063  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0066  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0016  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0806  hypothetical protein  96.55 
 
 		 108 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000935428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0026  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0028  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30863e-30 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0015  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000519668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0048  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0039  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.022052  normal  0.0225653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0028  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.500637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0025  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.89126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0024  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.664304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 67 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0051  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0061  tRNA-Gly  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0118  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119427  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t015  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000513165  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t012  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011091  hitchhiker  0.000000000474372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t011  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894711  hitchhiker  0.000000000511472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0106  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000012042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0109  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000980988  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0110  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000374074  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0829  tRNA-Gln  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000799298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0099  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0127  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0126  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0123  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00201303  hitchhiker  0.000458839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0114  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000001247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0117  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121705  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0010  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000890025  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0015  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1388  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.276257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>