33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1804 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1804  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0031996  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0484  hypothetical protein  53.85 
 
 
130 aa  150  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107148 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  41.61 
 
 
143 aa  110  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1403  hypothetical protein  45.8 
 
 
149 aa  110  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  46.67 
 
 
138 aa  106  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  40.15 
 
 
137 aa  100  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  32.12 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.865789 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  36.76 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  35.82 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3116  hypothetical protein  29.77 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.387996  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2599  hypothetical protein  29.77 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.651436  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2714  hypothetical protein  29.77 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000188359 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2227  hypothetical protein  29.77 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.989694 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0597  hypothetical protein  27.34 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1474  hypothetical protein  29.01 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0442  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.551708  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0776  hypothetical protein  31.69 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1553  hypothetical protein  29.08 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0352  hypothetical protein  29.77 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  23.23 
 
 
158 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  27.21 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2411  conserved hypothetical protein  28.87 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  26.67 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  26 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.13 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  23.9 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  31.58 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  28.91 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.52 
 
 
831 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  36.84 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  36.84 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2084  hypothetical protein  24.44 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0285787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1253  hypothetical protein  24.39 
 
 
203 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>