33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3116 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3116  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.387996  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2599  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.651436  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2227  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.989694 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2714  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000188359 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0597  hypothetical protein  43.41 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0442  conserved hypothetical protein  35.25 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.551708  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  34.09 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.865789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  33.82 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  33.81 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1804  hypothetical protein  29.77 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0031996  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  32.59 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0484  hypothetical protein  30.53 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0107148 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  28.15 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0352  hypothetical protein  29.03 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1403  hypothetical protein  32.31 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2084  hypothetical protein  35.11 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0285787  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.03 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0827  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2562  hypothetical protein  27.21 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000530705  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  40.82 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  29.08 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  26.4 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  32.63 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  25.85 
 
 		 170 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  31.08 
 
 		 166 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.32 
 
 		 813 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  25.17 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  26.49 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 356 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0352  hypothetical protein  26.53 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>