23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0352 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0352  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0442  conserved hypothetical protein  58.73 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.551708  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  33.58 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0597  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  28.36 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0484  hypothetical protein  28.46 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0107148 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1474  hypothetical protein  33.61 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2084  hypothetical protein  33.61 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0285787  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1403  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0776  hypothetical protein  35.37 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1804  hypothetical protein  29.77 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0031996  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1553  hypothetical protein  34.12 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  28.46 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1321  hypothetical protein  27.64 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1617  hypothetical protein  26.79 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.589663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2227  hypothetical protein  29.29 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.989694 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2714  hypothetical protein  29.29 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000188359 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2599  hypothetical protein  29.29 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.651436  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3116  hypothetical protein  29.29 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.387996  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  24.59 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  26.87 
 
 		 137 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.865789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2411  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>