14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1474 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1474  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  244  3e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1321  hypothetical protein  45.9 
 
 
124 aa  90.1  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1207  hypothetical protein  47.2 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.24022  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0442  conserved hypothetical protein  38.52 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.551708  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0484  hypothetical protein  32.5 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107148 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  36.64 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  32.81 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1617  hypothetical protein  29.37 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.589663  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  30.71 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1804  hypothetical protein  29.01 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0031996  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0352  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  29.6 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  27.56 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  34.62 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.865789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>