20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3125 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3125  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  100 
 
 		 147 aa  278  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0194025  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  37.04 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  34.56 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  37.41 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  37.41 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  36.69 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  34.53 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  31.15 
 
 		 156 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2406  hypothetical protein  35.56 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  31.16 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  37.25 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  33.82 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  34.06 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  30.19 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  31.58 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  32.52 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  35.11 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  34.88 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  34.06 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  28.35 
 
 		 162 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>