25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2298 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2298  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2346  hypothetical protein  48.59 
 
 		 143 aa  159  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271163  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2711  hypothetical protein  50.35 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2680  hypothetical protein  49.65 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2725  hypothetical protein  49.65 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.206412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4027  hypothetical protein  47.18 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11579  hypothetical protein  46.48 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4513  hypothetical protein  47.89 
 
 		 143 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4426  hypothetical protein  47.89 
 
 		 143 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4807  hypothetical protein  47.89 
 
 		 143 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10928  hypothetical protein  47.18 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1760  hypothetical protein  45.77 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535076  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4987  hypothetical protein  44.14 
 
 		 148 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1288  Polyketide cyclase/dehydrase  46.67 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3139  hypothetical protein  39.01 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3386  hypothetical protein  35.92 
 
 		 143 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2568  hypothetical protein  34.51 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2607  hypothetical protein  34.51 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0322023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2613  hypothetical protein  34.51 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2339  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711585  hitchhiker  0.0040071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5278  Polyketide cyclase/dehydrase  28.47 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2680  hypothetical protein  25.35 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2888  hypothetical protein  29.17 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0981283  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  28.04 
 
 		 378 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2432  cyclase/dehydrase  24.67 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137683  normal  0.165431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>