23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2888 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2888  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  286  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0981283  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2680  hypothetical protein  81.82 
 
 		 143 aa  235  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4513  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11579  hypothetical protein  34.75 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10928  hypothetical protein  30.28 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1760  hypothetical protein  31.88 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535076  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3139  hypothetical protein  31.21 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4987  hypothetical protein  29.79 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2339  hypothetical protein  28.67 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711585  hitchhiker  0.0040071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5278  Polyketide cyclase/dehydrase  31.97 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2298  Polyketide cyclase/dehydrase  27.46 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3386  hypothetical protein  29.58 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271163  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1288  Polyketide cyclase/dehydrase  34.86 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2711  hypothetical protein  26.24 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2568  hypothetical protein  25.35 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2607  hypothetical protein  25.35 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0322023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2725  hypothetical protein  25.53 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.206412 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2613  hypothetical protein  25.35 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2680  hypothetical protein  25.53 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4027  hypothetical protein  33.01 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>