22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1288 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1288  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2298  Polyketide cyclase/dehydrase  46.67 
 
 
144 aa  134  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11579  hypothetical protein  46.32 
 
 
143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1760  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  123  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535076  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4426  hypothetical protein  46.32 
 
 
143 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4513  hypothetical protein  46.32 
 
 
143 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4807  hypothetical protein  46.32 
 
 
143 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10928  hypothetical protein  47.79 
 
 
144 aa  120  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2711  hypothetical protein  41.48 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4987  hypothetical protein  48.2 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2725  hypothetical protein  41.48 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.206412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2680  hypothetical protein  41.48 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2346  hypothetical protein  42.75 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271163  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4027  hypothetical protein  38.06 
 
 
143 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3386  hypothetical protein  40.3 
 
 
143 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3139  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376629  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2568  hypothetical protein  37.4 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2613  hypothetical protein  37.4 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2607  hypothetical protein  37.4 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0322023  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2339  hypothetical protein  31.11 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711585  hitchhiker  0.0040071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2888  hypothetical protein  34.86 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0981283  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2680  hypothetical protein  32.52 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  0.137486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>