23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10928 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10928  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  290  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1760  hypothetical protein  72.73 
 
 
145 aa  223  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535076  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4426  hypothetical protein  72.73 
 
 
143 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4513  hypothetical protein  72.73 
 
 
143 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4807  hypothetical protein  72.73 
 
 
143 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4987  hypothetical protein  71.92 
 
 
148 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2298  Polyketide cyclase/dehydrase  47.18 
 
 
144 aa  141  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2346  hypothetical protein  41.96 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271163  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4027  hypothetical protein  38.46 
 
 
143 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1288  Polyketide cyclase/dehydrase  47.79 
 
 
137 aa  120  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11579  hypothetical protein  37.06 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2711  hypothetical protein  39.44 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2725  hypothetical protein  38.73 
 
 
144 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.206412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2680  hypothetical protein  38.73 
 
 
144 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3139  hypothetical protein  39.86 
 
 
142 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376629  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3386  hypothetical protein  40.29 
 
 
143 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2607  hypothetical protein  35.92 
 
 
143 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0322023  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2568  hypothetical protein  35.92 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2613  hypothetical protein  35.92 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2888  hypothetical protein  32.52 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0981283  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2680  hypothetical protein  28.17 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2339  hypothetical protein  26.83 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711585  hitchhiker  0.0040071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5278  Polyketide cyclase/dehydrase  24.81 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>