23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2680 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2680  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  292  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2725  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  292  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.206412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2711  hypothetical protein  99.3 
 
 
143 aa  288  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4027  hypothetical protein  67.61 
 
 
143 aa  208  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2346  hypothetical protein  64.08 
 
 
143 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271163  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11579  hypothetical protein  58.45 
 
 
143 aa  176  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2298  Polyketide cyclase/dehydrase  49.65 
 
 
144 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1288  Polyketide cyclase/dehydrase  41.48 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1760  hypothetical protein  38.73 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535076  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4987  hypothetical protein  38.62 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4807  hypothetical protein  40.14 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4513  hypothetical protein  40.14 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4426  hypothetical protein  40.14 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10928  hypothetical protein  38.73 
 
 
144 aa  114  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3139  hypothetical protein  34.75 
 
 
142 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376629  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3386  hypothetical protein  33.1 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2607  hypothetical protein  30.99 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0322023  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2568  hypothetical protein  30.99 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2613  hypothetical protein  30.99 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2339  hypothetical protein  29.71 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711585  hitchhiker  0.0040071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2680  hypothetical protein  25.53 
 
 
143 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2888  hypothetical protein  29.17 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0981283  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5278  Polyketide cyclase/dehydrase  27.69 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>