23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2680 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2680  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2888  hypothetical protein  81.82 
 
 		 143 aa  219  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0981283  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4426  hypothetical protein  30.43 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4513  hypothetical protein  30.43 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4807  hypothetical protein  30.43 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11579  hypothetical protein  31.91 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10928  hypothetical protein  28.17 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1760  hypothetical protein  28.99 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535076  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3139  hypothetical protein  28.37 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2339  hypothetical protein  26.81 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711585  hitchhiker  0.0040071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4987  hypothetical protein  26.24 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2346  hypothetical protein  32.69 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271163  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2711  hypothetical protein  26.24 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2298  Polyketide cyclase/dehydrase  25.35 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2607  hypothetical protein  25.35 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0322023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2613  hypothetical protein  25.35 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2568  hypothetical protein  25.35 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2725  hypothetical protein  25.53 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.206412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2680  hypothetical protein  25.53 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5278  Polyketide cyclase/dehydrase  29.2 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1288  Polyketide cyclase/dehydrase  32.52 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3386  hypothetical protein  26.76 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4027  hypothetical protein  33 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>