23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11579 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11579  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  286  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2711  hypothetical protein  59.15 
 
 
143 aa  178  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2680  hypothetical protein  58.45 
 
 
144 aa  176  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2725  hypothetical protein  58.45 
 
 
144 aa  176  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.206412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2346  hypothetical protein  52.11 
 
 
143 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271163  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4027  hypothetical protein  50.7 
 
 
143 aa  158  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2298  Polyketide cyclase/dehydrase  46.48 
 
 
144 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4513  hypothetical protein  41.26 
 
 
143 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4807  hypothetical protein  41.26 
 
 
143 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4426  hypothetical protein  41.26 
 
 
143 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1288  Polyketide cyclase/dehydrase  46.32 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1760  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535076  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3139  hypothetical protein  38.3 
 
 
142 aa  120  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376629  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4987  hypothetical protein  38.36 
 
 
148 aa  120  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10928  hypothetical protein  37.06 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3386  hypothetical protein  35.92 
 
 
143 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2568  hypothetical protein  34.97 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2613  hypothetical protein  34.97 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2607  hypothetical protein  34.27 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0322023  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2888  hypothetical protein  39.17 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0981283  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2680  hypothetical protein  31.91 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2339  hypothetical protein  26.24 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711585  hitchhiker  0.0040071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5278  Polyketide cyclase/dehydrase  23.36 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>