25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1883 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1883  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  314  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2250  hypothetical protein  59.86 
 
 		 195 aa  168  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.276197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2466  putative alanine rich transmembrane protein  56.38 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2190  putative alanine rich transmembrane protein  52.74 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.492449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2236  putative alanine rich transmembrane protein  52.74 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0523981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2179  putative alanine rich transmembrane protein  52.74 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993519  hitchhiker  0.0017375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3934  putative alanine rich transmembrane protein  52.05 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12713  alanine rich membrane protein  56.88 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0350058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1514  hypothetical protein  41.78 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250782  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24270  hypothetical protein  43.06 
 
 		 171 aa  103  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0985474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1480  hypothetical protein  45.99 
 
 		 176 aa  99.8  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.319539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1445  hypothetical protein  44.67 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181337  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4533  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523633  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2909  secreted protein  36.3 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1923  hypothetical protein  48.94 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0454052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1634  hypothetical protein  33.96 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574165  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1556  membrane protein  46.88 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1702  hypothetical protein  41.67 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0073686  normal  0.175471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1635  membrane protein  31.41 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.026757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1628  membrane protein  32.21 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000126494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13130  hypothetical protein  36.89 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0043246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1936  hypothetical protein  29.08 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0500735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16110  hypothetical protein  35.53 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.483864  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14490  hypothetical protein  32.18 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.679471  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1403  hypothetical protein  29.11 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>