21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1403 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1403  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  359  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1635  membrane protein  32.95 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.026757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2909  secreted protein  33.99 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2250  hypothetical protein  34.15 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.276197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4533  hypothetical protein  29.63 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523633  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1936  hypothetical protein  40.26 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0500735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1883  hypothetical protein  29.87 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1702  hypothetical protein  36.67 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0073686  normal  0.175471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1445  hypothetical protein  29.01 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181337  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2466  putative alanine rich transmembrane protein  30.63 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24270  hypothetical protein  23.27 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0985474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1628  membrane protein  29.22 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000126494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1556  membrane protein  34.59 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1480  hypothetical protein  32.17 
 
 		 176 aa  48.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.319539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2179  putative alanine rich transmembrane protein  30.13 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993519  hitchhiker  0.0017375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2236  putative alanine rich transmembrane protein  30.13 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0523981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2190  putative alanine rich transmembrane protein  29.59 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.492449  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3934  putative alanine rich transmembrane protein  28.93 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16110  hypothetical protein  41.03 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.483864  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1514  hypothetical protein  29.41 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250782  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13130  hypothetical protein  26.23 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0043246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>