25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2250 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2250  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.276197  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1883  hypothetical protein  59.86 
 
 		 157 aa  168  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2190  putative alanine rich transmembrane protein  54.05 
 
 		 170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.492449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2236  putative alanine rich transmembrane protein  54.05 
 
 		 159 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0523981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2179  putative alanine rich transmembrane protein  54.05 
 
 		 159 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993519  hitchhiker  0.0017375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2466  putative alanine rich transmembrane protein  54.42 
 
 		 159 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3934  putative alanine rich transmembrane protein  51.02 
 
 		 158 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12713  alanine rich membrane protein  64.42 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0350058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24270  hypothetical protein  43.84 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0985474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1480  hypothetical protein  43.38 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.319539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1445  hypothetical protein  43.36 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181337  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1514  hypothetical protein  39.44 
 
 		 174 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4533  hypothetical protein  41.38 
 
 		 168 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523633  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2909  secreted protein  37.93 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223791  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1635  membrane protein  38.1 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.026757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1634  hypothetical protein  38 
 
 		 149 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574165  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1923  hypothetical protein  48.78 
 
 		 164 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0454052  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1702  hypothetical protein  44.3 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0073686  normal  0.175471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1556  membrane protein  45.57 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1628  membrane protein  33.1 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000126494 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1403  hypothetical protein  32.93 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13130  hypothetical protein  34.9 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0043246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1936  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0500735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14490  hypothetical protein  26.35 
 
 		 179 aa  52  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.679471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16110  hypothetical protein  29.21 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.483864  normal  0.136593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>