25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1635 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1635  membrane protein  100 
 
 
162 aa  316  7.999999999999999e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.026757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1628  membrane protein  70.55 
 
 
161 aa  220  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000126494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13130  hypothetical protein  54.66 
 
 
180 aa  169  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0043246  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14490  hypothetical protein  34.21 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.679471  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1702  hypothetical protein  34.53 
 
 
168 aa  84  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0073686  normal  0.175471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1923  hypothetical protein  43.01 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0454052  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2250  hypothetical protein  38.1 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.276197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1556  membrane protein  38.84 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2909  secreted protein  33.1 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1514  hypothetical protein  36 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1936  hypothetical protein  30.28 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0500735 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24270  hypothetical protein  30.34 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0985474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4533  hypothetical protein  31.79 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523633  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1883  hypothetical protein  31.41 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1480  hypothetical protein  32.59 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.319539  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1445  hypothetical protein  33.59 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181337  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3934  putative alanine rich transmembrane protein  33.55 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2466  putative alanine rich transmembrane protein  33.33 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1403  hypothetical protein  32.39 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2190  putative alanine rich transmembrane protein  31.9 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.492449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2179  putative alanine rich transmembrane protein  31.37 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993519  hitchhiker  0.0017375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2236  putative alanine rich transmembrane protein  31.37 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0523981  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16110  hypothetical protein  28.48 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.483864  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1634  hypothetical protein  31.51 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574165  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12713  alanine rich membrane protein  46.15 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0350058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>