19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14490 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_14490  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  350  7e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.679471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1635  membrane protein  34.21 
 
 
162 aa  94.4  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.026757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1702  hypothetical protein  40.99 
 
 
168 aa  94  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0073686  normal  0.175471 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13130  hypothetical protein  34.71 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0043246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1628  membrane protein  31.47 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000126494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2909  secreted protein  38.19 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1923  hypothetical protein  43.66 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0454052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1936  hypothetical protein  34.81 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0500735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1514  hypothetical protein  41.67 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16110  hypothetical protein  33.97 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.483864  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4533  hypothetical protein  38.75 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523633  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1556  membrane protein  28.97 
 
 
157 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2250  hypothetical protein  26.35 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.276197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24270  hypothetical protein  30.77 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0985474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1883  hypothetical protein  33.77 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1634  hypothetical protein  32.64 
 
 
149 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574165  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1445  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  47.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181337  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1480  hypothetical protein  32.61 
 
 
176 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.319539  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2466  putative alanine rich transmembrane protein  27.27 
 
 
159 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>