23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12713 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12713  alanine rich membrane protein  100 
 
 		 161 aa  313  7e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0350058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2236  putative alanine rich transmembrane protein  71.7 
 
 		 159 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0523981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2179  putative alanine rich transmembrane protein  71.7 
 
 		 159 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993519  hitchhiker  0.0017375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2190  putative alanine rich transmembrane protein  71.07 
 
 		 170 aa  220  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.492449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2466  putative alanine rich transmembrane protein  63.98 
 
 		 159 aa  202  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3934  putative alanine rich transmembrane protein  62.11 
 
 		 158 aa  200  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1883  hypothetical protein  52.98 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2250  hypothetical protein  55.7 
 
 		 195 aa  142  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.276197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24270  hypothetical protein  45.33 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0985474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1514  hypothetical protein  41.61 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1480  hypothetical protein  41.84 
 
 		 176 aa  103  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.319539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4533  hypothetical protein  39.46 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523633  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1445  hypothetical protein  42 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181337  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2909  secreted protein  34.69 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1702  hypothetical protein  38.05 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0073686  normal  0.175471 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1628  membrane protein  31.33 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000126494 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1923  hypothetical protein  45.45 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0454052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1556  membrane protein  31.88 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1634  hypothetical protein  29.87 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574165  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1635  membrane protein  31.37 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.026757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1936  hypothetical protein  36.14 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0500735 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13130  hypothetical protein  28.83 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0043246  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16110  hypothetical protein  31.88 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.483864  normal  0.136593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>