30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3161 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  797    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  41.29 
 
 
429 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  40.05 
 
 
387 aa  262  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  34.62 
 
 
426 aa  190  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  30.96 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  33.25 
 
 
395 aa  182  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  33.25 
 
 
395 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  32.33 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  31.08 
 
 
391 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  30.89 
 
 
394 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  31.08 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  27.16 
 
 
404 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  29.65 
 
 
391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  29.79 
 
 
392 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  28.68 
 
 
391 aa  132  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  26.63 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  27.3 
 
 
391 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  30.18 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  31.28 
 
 
384 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  30.92 
 
 
441 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  32.39 
 
 
403 aa  122  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  24.52 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  29.77 
 
 
408 aa  93.2  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  38.69 
 
 
145 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  27.05 
 
 
383 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  27.02 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  27.01 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  42.86 
 
 
101 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  40.74 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  41.18 
 
 
92 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>