28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0867 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  867    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  41.29 
 
 
398 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  33.09 
 
 
387 aa  189  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  29.7 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  30.43 
 
 
395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  29.11 
 
 
426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  29.31 
 
 
395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  33.21 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  29.95 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  33.21 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  30.5 
 
 
404 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  31.46 
 
 
397 aa  123  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  33.97 
 
 
405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  27.29 
 
 
394 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  32.82 
 
 
401 aa  120  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  33.58 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  29.31 
 
 
384 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  29.85 
 
 
391 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  30.38 
 
 
392 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  31.18 
 
 
391 aa  106  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  28.07 
 
 
403 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  31.25 
 
 
145 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  28.06 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  21.69 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  22.35 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  31.06 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  29.53 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  46.03 
 
 
101 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>