31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1134 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  39.69 
 
 
394 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  35.53 
 
 
404 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  36.22 
 
 
391 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  35.23 
 
 
391 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  39.23 
 
 
395 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  33.94 
 
 
391 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  33.94 
 
 
391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  36.43 
 
 
395 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  34.63 
 
 
403 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  32.12 
 
 
397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  37.24 
 
 
404 aa  215  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  34.95 
 
 
405 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  33.93 
 
 
401 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  34.27 
 
 
392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  34.49 
 
 
441 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  33.7 
 
 
387 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  31.28 
 
 
398 aa  126  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  31.03 
 
 
426 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  29.96 
 
 
413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  40.31 
 
 
145 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  29.31 
 
 
429 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  64.63 
 
 
101 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  29.43 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  32.05 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  26.4 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  34.55 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  28.74 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  46.38 
 
 
92 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  35 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0776  hypothetical protein  27.38 
 
 
459 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0148333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>