31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0740 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  778    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  66.49 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  50.89 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  49.74 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  51.15 
 
 		 391 aa  375  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  50 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  48.48 
 
 		 404 aa  359  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  48.88 
 
 		 405 aa  355  7.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  47.38 
 
 		 401 aa  345  8e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  47.57 
 
 		 403 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  47.84 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  50.64 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  47.96 
 
 		 392 aa  332  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  45.01 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  36.27 
 
 		 394 aa  232  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  36.43 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  33.25 
 
 		 398 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  34.48 
 
 		 387 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  56.72 
 
 		 145 aa  159  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  42.62 
 
 		 426 aa  146  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  32.8 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  29.31 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  27.88 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  26.61 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  26.12 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  51.9 
 
 		 101 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  25.06 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  56.25 
 
 		 92 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  29.62 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0773  hypothetical protein  44.83 
 
 		 109 aa  47.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  31.03 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>