31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1439 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  91.37 
 
 
391 aa  264  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  85.51 
 
 
391 aa  247  5e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  78.99 
 
 
397 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  71.53 
 
 
391 aa  212  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  61.76 
 
 
391 aa  191  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  64.23 
 
 
404 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  59.56 
 
 
403 aa  183  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  58.09 
 
 
441 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  56.72 
 
 
395 aa  159  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  53.96 
 
 
392 aa  155  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  56.59 
 
 
404 aa  154  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  54.29 
 
 
395 aa  147  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  47.79 
 
 
401 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  41.27 
 
 
394 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  40.31 
 
 
384 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  39.57 
 
 
413 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  37.23 
 
 
426 aa  99  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  37.12 
 
 
387 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  38.69 
 
 
398 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  61.76 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  31.25 
 
 
429 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  28.38 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  42.5 
 
 
101 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  32.12 
 
 
383 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  31.85 
 
 
381 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  34.62 
 
 
384 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  30.26 
 
 
408 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0773  hypothetical protein  37.35 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  24.26 
 
 
412 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>