30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0844 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  814    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  79.23 
 
 
391 aa  646    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  78.72 
 
 
391 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  69.67 
 
 
391 aa  567  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  65.72 
 
 
391 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  63.4 
 
 
404 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  59.24 
 
 
403 aa  490  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  55.05 
 
 
404 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  51.66 
 
 
392 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  51.28 
 
 
401 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  51.79 
 
 
405 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  49.77 
 
 
441 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  49.74 
 
 
395 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  49.11 
 
 
395 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  34.47 
 
 
394 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  78.99 
 
 
145 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  32.12 
 
 
384 aa  216  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  33.33 
 
 
387 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  34.78 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  26.63 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  35.6 
 
 
426 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  31.46 
 
 
429 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  66.67 
 
 
92 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  24.48 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  24.11 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  23.68 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  25.47 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  47.3 
 
 
101 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  23.26 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  26.62 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>