30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0014 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  100 
 
 
392 aa  789    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  52.3 
 
 
391 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  51.66 
 
 
397 aa  421  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  54.34 
 
 
391 aa  421  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  51.53 
 
 
391 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  54.31 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  52.05 
 
 
404 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  53.93 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  52.34 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  51.42 
 
 
403 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  48.96 
 
 
401 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  49.48 
 
 
405 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  47.96 
 
 
395 aa  332  8e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  47.47 
 
 
395 aa  329  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  35.04 
 
 
394 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  34.27 
 
 
384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  34.46 
 
 
387 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  53.96 
 
 
145 aa  155  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  29.79 
 
 
398 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  31.23 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  30.38 
 
 
429 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  26.89 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  21.97 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  25.44 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  26.53 
 
 
394 aa  63.5  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  28.37 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  46.25 
 
 
101 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  25.06 
 
 
383 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  42.65 
 
 
92 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  25.83 
 
 
412 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>