34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0130 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  100 
 
 
382 aa  738    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  42.75 
 
 
405 aa  266  5e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  42.78 
 
 
425 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  45.76 
 
 
425 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  42.7 
 
 
417 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  42.13 
 
 
444 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  42.11 
 
 
443 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  43.15 
 
 
409 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  32.33 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  30.96 
 
 
474 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  39.52 
 
 
443 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  31.29 
 
 
474 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  31.63 
 
 
472 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  33.83 
 
 
481 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  32.91 
 
 
474 aa  189  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  31.73 
 
 
474 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  33.58 
 
 
481 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  32.91 
 
 
474 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  33.58 
 
 
481 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  33.58 
 
 
481 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  31.47 
 
 
474 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  33.76 
 
 
473 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  31.4 
 
 
475 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  34.36 
 
 
461 aa  186  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  22.56 
 
 
406 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.9 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.75 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  20.98 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  21.31 
 
 
395 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1017  Cytochrome c biogenesis protein-like protein  22.92 
 
 
519 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  23.74 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  39.74 
 
 
133 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0072  thioredoxin domain-containing protein  30.14 
 
 
134 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  43.04 
 
 
134 aa  42.7  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>