35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0187 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  751    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.52 
 
 		 286 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.65 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1017  Cytochrome c biogenesis protein-like protein  23.81 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.58 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1106  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  20.57 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0493  vitamin K epoxide reductase  33.67 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2189  glutaredoxin 2  26.71 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.178053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  26.32 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  26.38 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0795  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  22.97 
 
 		 927 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.337391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  26.09 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3618  Vitamin K epoxide reductase  25.71 
 
 		 339 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00203549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  28.74 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  25.8 
 
 		 481 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  26.95 
 
 		 474 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  27.87 
 
 		 479 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  28.46 
 
 		 474 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  28.46 
 
 		 474 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  24.58 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  27.67 
 
 		 481 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  24.44 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  26.38 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  28.82 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  27.67 
 
 		 474 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3135  cytochrome c-type biogenesis protein  24.03 
 
 		 273 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0405537  normal  0.432106 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  25.14 
 
 		 443 aa  46.6  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  23.11 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  26.89 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.3 
 
 		 616 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.3 
 
 		 616 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  27.51 
 
 		 474 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3474  thiol:disulfide interchange protein  26.14 
 
 		 558 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149531  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  27.13 
 
 		 472 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3381  hypothetical protein  23.47 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  hitchhiker  0.00468536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>