33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0270 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  837    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  59 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  60.57 
 
 		 425 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  60.44 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  59.89 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  39.86 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  40.09 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  39.07 
 
 		 474 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  41.63 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  41.09 
 
 		 475 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  39.16 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  39.15 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  40.6 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  39.01 
 
 		 474 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  38.84 
 
 		 481 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  38.84 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  38.84 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  40.05 
 
 		 474 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  39.67 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  42.72 
 
 		 461 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  45.48 
 
 		 443 aa  267  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  42.62 
 
 		 382 aa  246  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  36.02 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  37.11 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  20.52 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.38 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.16 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  26.3 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.1 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0072  thioredoxin domain-containing protein  34.21 
 
 		 134 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  20.73 
 
 		 395 aa  57  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  21.47 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3135  cytochrome c-type biogenesis protein  24.57 
 
 		 273 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0405537  normal  0.432106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>