34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4013 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  89.86 
 
 		 444 aa  685    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  874    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  58.6 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  57.89 
 
 		 417 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  57.8 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  41.55 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  39.53 
 
 		 473 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  41.09 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  39.86 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  39.81 
 
 		 474 aa  306  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  39.07 
 
 		 481 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  39.07 
 
 		 481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  38.84 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  38.6 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  38.89 
 
 		 474 aa  302  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  40.24 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  39.48 
 
 		 479 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  39.86 
 
 		 475 aa  289  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  39.51 
 
 		 474 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  39.23 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  45.04 
 
 		 443 aa  260  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  41.71 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  41.9 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  38.05 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  22.07 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.15 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.17 
 
 		 286 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  25.14 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  21.97 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0072  thioredoxin domain-containing protein  34.67 
 
 		 134 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  24.76 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0866  hypothetical protein  27.59 
 
 		 173 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1106  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  21.79 
 
 		 366 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>