49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3231 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 379 aa  760    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.89 
 
 		 286 aa  206  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.89 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  26.72 
 
 		 425 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1106  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.4 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3135  cytochrome c-type biogenesis protein  32.03 
 
 		 273 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0405537  normal  0.432106 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  27.51 
 
 		 443 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  27.22 
 
 		 444 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  24.38 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0866  hypothetical protein  38.14 
 
 		 173 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  26.97 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  25.13 
 
 		 474 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  24.81 
 
 		 473 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  23.35 
 
 		 474 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0856  hypothetical protein  35.94 
 
 		 152 aa  89.4  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.386064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  24.93 
 
 		 443 aa  87.4  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  24.31 
 
 		 481 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  24.11 
 
 		 474 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  25.63 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  23.1 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  24.63 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  24.06 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  24.06 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  23.81 
 
 		 481 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1175  hypothetical protein  28.9 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  29.18 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  25.35 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  25.38 
 
 		 474 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  23.93 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1017  Cytochrome c biogenesis protein-like protein  24.24 
 
 		 519 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  22.79 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1735  hypothetical protein  27.05 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  25.61 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  26.58 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  25.16 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1531  hypothetical protein  29.66 
 
 		 156 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0795  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.03 
 
 		 927 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.337391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  21.97 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  21.15 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0143  hypothetical protein  27.34 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2189  glutaredoxin 2  22.04 
 
 		 510 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.178053  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2198  hypothetical protein  28.12 
 
 		 149 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.378806  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.61 
 
 		 222 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  29.61 
 
 		 222 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3381  hypothetical protein  20.89 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  hitchhiker  0.00468536 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  20.95 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  21.59 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  26.74 
 
 		 396 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3286  cytochrome c biogenesis protein  29.1 
 
 		 237 aa  43.1  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>