19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1017 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1017  Cytochrome c biogenesis protein-like protein  100 
 
 
519 aa  1041    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2189  glutaredoxin 2  29.41 
 
 
510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.178053  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.2 
 
 
379 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  23.78 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3135  cytochrome c-type biogenesis protein  24.9 
 
 
273 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0405537  normal  0.432106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  21.74 
 
 
405 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  23.08 
 
 
325 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  22.41 
 
 
443 aa  52.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.78 
 
 
224 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.27 
 
 
563 aa  47.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.7 
 
 
583 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  20.87 
 
 
474 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.9 
 
 
583 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  31.73 
 
 
735 aa  44.3  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.4 
 
 
570 aa  44.3  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.89 
 
 
286 aa  43.9  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1106  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  19.62 
 
 
366 aa  43.9  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.88 
 
 
565 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  20.66 
 
 
382 aa  43.5  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>