45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0855 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 373 aa  744    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.18 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.87 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  27.76 
 
 		 425 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  24.71 
 
 		 473 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  24.25 
 
 		 481 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  23.45 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  23.69 
 
 		 481 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3135  cytochrome c-type biogenesis protein  27.31 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0405537  normal  0.432106 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  23.6 
 
 		 474 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  24.18 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  23.48 
 
 		 474 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  23.6 
 
 		 474 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  23.94 
 
 		 481 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  24 
 
 		 481 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  23.23 
 
 		 474 aa  86.3  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  25 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  25.58 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1106  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.41 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  22.81 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  22.98 
 
 		 474 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  28.95 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  22.47 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  24.86 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  24.3 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  24.36 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1175  hypothetical protein  28.9 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  25.59 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2198  hypothetical protein  27.87 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.378806  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  22.65 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  23.94 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0856  hypothetical protein  31.46 
 
 		 152 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.386064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2189  glutaredoxin 2  25.29 
 
 		 510 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.178053  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1531  hypothetical protein  25.96 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0866  hypothetical protein  27.72 
 
 		 173 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1017  Cytochrome c biogenesis protein-like protein  24.02 
 
 		 519 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1244  hypothetical protein  26.61 
 
 		 176 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1277  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.23 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  22.8 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0795  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.95 
 
 		 927 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.337391  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1735  hypothetical protein  25.88 
 
 		 154 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  32.76 
 
 		 103 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  22.52 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  21.45 
 
 		 395 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>