17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2182 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2182  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  359  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1215  membrane protein  25.81 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4481  hypothetical protein  31.15 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0467  hypothetical protein  30.61 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0491  hypothetical protein  30.61 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0315  hypothetical protein  32.41 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.307518  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1758  hypothetical protein  26.96 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.976811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0998  hypothetical protein  28.69 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2717  hypothetical protein  29.35 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2284  hypothetical protein  26.96 
 
 		 187 aa  51.6  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28090  hypothetical protein  27.55 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00135533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3871  hypothetical protein  30.93 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2136  hypothetical protein  29.59 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.125305 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2301  hypothetical protein  25.22 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2170  hypothetical protein  25.22 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4331  hypothetical protein  29.7 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5040  hypothetical protein  24.35 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.95774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>