20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4331 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4331  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  361  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4481  hypothetical protein  67.58 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0998  hypothetical protein  70.29 
 
 		 191 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0315  hypothetical protein  41.96 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.307518  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4791  hypothetical protein  38.71 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267753  normal  0.751838 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2301  hypothetical protein  26.49 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2170  hypothetical protein  26.49 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1215  membrane protein  31.11 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0376  hypothetical protein  36 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1758  hypothetical protein  26.34 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.976811 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2284  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2182  hypothetical protein  29.51 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28090  hypothetical protein  32.38 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00135533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5040  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  50.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.95774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1666  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2717  hypothetical protein  33.91 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631698  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0491  hypothetical protein  23.48 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0467  hypothetical protein  23.48 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6189  hypothetical protein  27.64 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71320  hypothetical protein  27.64 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.941718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>