17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0998 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0998  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4481  hypothetical protein  75.39 
 
 		 191 aa  284  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4331  hypothetical protein  70.29 
 
 		 184 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0315  hypothetical protein  45.58 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.307518  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4791  hypothetical protein  41.13 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267753  normal  0.751838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0376  hypothetical protein  38.32 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1215  membrane protein  26.4 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28090  hypothetical protein  36.19 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00135533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2182  hypothetical protein  28.69 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2301  hypothetical protein  30.09 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2170  hypothetical protein  30.09 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1758  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.976811 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2284  hypothetical protein  29.2 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5040  hypothetical protein  25.27 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.95774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1666  hypothetical protein  27.73 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2136  hypothetical protein  25.45 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.125305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>