15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28090 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_28090  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  362  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00135533  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2284  hypothetical protein  51.6 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2301  hypothetical protein  51.06 
 
 
187 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2170  hypothetical protein  51.06 
 
 
187 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1758  hypothetical protein  48.39 
 
 
186 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.976811 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5040  hypothetical protein  50.8 
 
 
186 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.95774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1666  hypothetical protein  49.2 
 
 
186 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0315  hypothetical protein  32.17 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.307518  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0998  hypothetical protein  34.15 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4481  hypothetical protein  31.11 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197707  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0491  hypothetical protein  32.11 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0467  hypothetical protein  32.11 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1215  membrane protein  28.16 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2182  hypothetical protein  29.66 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4331  hypothetical protein  31.75 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>