15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1758 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1758  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.976811 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1666  hypothetical protein  91.94 
 
 
186 aa  327  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5040  hypothetical protein  91.4 
 
 
186 aa  323  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.95774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2301  hypothetical protein  80.21 
 
 
187 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2170  hypothetical protein  80.21 
 
 
187 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2284  hypothetical protein  79.68 
 
 
187 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28090  hypothetical protein  48.39 
 
 
185 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00135533  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4481  hypothetical protein  25.27 
 
 
191 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197707  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0315  hypothetical protein  31.3 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.307518  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2182  hypothetical protein  26.96 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0998  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1215  membrane protein  28.32 
 
 
182 aa  48.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4331  hypothetical protein  26.34 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6189  hypothetical protein  27.84 
 
 
189 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71320  hypothetical protein  27.27 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.941718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>