18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4481 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4481  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0998  hypothetical protein  75.39 
 
 		 191 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4331  hypothetical protein  67.58 
 
 		 184 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0315  hypothetical protein  45.89 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.307518  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4791  hypothetical protein  40.8 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267753  normal  0.751838 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2182  hypothetical protein  31.15 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1215  membrane protein  25 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2301  hypothetical protein  30.09 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2170  hypothetical protein  30.09 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0376  hypothetical protein  36.45 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1758  hypothetical protein  25.27 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.976811 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2284  hypothetical protein  29.2 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28090  hypothetical protein  29.7 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00135533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2717  hypothetical protein  35.48 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5040  hypothetical protein  26.92 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.95774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1666  hypothetical protein  26.37 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2136  hypothetical protein  25.45 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.125305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4034  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.85 
 
 		 533 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.938512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>