207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0030 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase, putative  100 
 
 
259 aa  506  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000620053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2837  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.27 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2523  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.08 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0062  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.82 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.14 
 
 
263 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000370596  hitchhiker  0.000000000404856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2869  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.98 
 
 
267 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.62 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.4 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0905  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.14 
 
 
267 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.98 
 
 
301 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.98 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.38 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1235  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.23 
 
 
269 aa  79  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1116  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.56 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.24 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0486  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.91 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1412  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.77 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.05 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.27 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.532012  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0951  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.2 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0966  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.96 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00202083  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_839  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.19 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00921901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3677  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.95 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1890  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.25 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00906876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0909  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.4 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.173456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.63 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.337573  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4345  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25 
 
 
285 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.96 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0431  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.07 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.40782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4492  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.73 
 
 
321 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0357938  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3773  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.17 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.884647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.9 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1789  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.95 
 
 
271 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0857  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.91 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653455  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0456  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.29 
 
 
271 aa  62  0.000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2305  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.02 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.537495  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1550  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.91 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1088  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.44 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.626064  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04851  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.63 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.44 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.23 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0790  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.96 
 
 
293 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1308  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.24 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0767  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.96 
 
 
293 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1165  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.81 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1192  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.81 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0904  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.39 
 
 
293 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4306  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25 
 
 
290 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.8 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25 
 
 
262 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0661  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.41 
 
 
295 aa  58.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.2 
 
 
285 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.24 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1060  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.73 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.92 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.55 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.14 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1349  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.96 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0795  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.34 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.1 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0393  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.73 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0427  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.46 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.615828  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0349  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.87 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.75 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.75 
 
 
298 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1865  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.1 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.827419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.75 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0417  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.89 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1408  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.14 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.997076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.51 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2731  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.56 
 
 
283 aa  55.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05241  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.88 
 
 
297 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25 
 
 
296 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0992  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.22 
 
 
271 aa  55.5  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3817  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.7 
 
 
305 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311868  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.83 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.52 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05161  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.33 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.51 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.51 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.48 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3071  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.77 
 
 
298 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126836 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.64 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1450  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.44 
 
 
301 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1899  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.31 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.651881  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.91 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.23 
 
 
279 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.32 
 
 
280 aa  53.1  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.87 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.17 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.87 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.64 
 
 
296 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.64 
 
 
296 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.27 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.97 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1732  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  22.69 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.64 
 
 
296 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.64 
 
 
296 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.64 
 
 
296 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>