More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1233 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.66 
 
 
284 aa  461  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171853  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1308  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  78.83 
 
 
300 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0795  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  74.91 
 
 
285 aa  425  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1060  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  69.58 
 
 
284 aa  422  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2305  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  73.21 
 
 
288 aa  421  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.537495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1088  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  71.38 
 
 
281 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.626064  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1349  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  68.93 
 
 
282 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.51 
 
 
262 aa  215  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.46 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.69 
 
 
267 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.38 
 
 
266 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.38 
 
 
266 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.14 
 
 
285 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0703  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.21 
 
 
294 aa  203  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.609213 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1342  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.21 
 
 
294 aa  203  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.53 
 
 
261 aa  202  5e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.51 
 
 
266 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.91 
 
 
271 aa  201  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.92 
 
 
265 aa  201  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.53 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0427  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.91 
 
 
271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.615828  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.91 
 
 
270 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0855  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40 
 
 
279 aa  199  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.97 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.96 
 
 
262 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.45 
 
 
280 aa  199  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.97 
 
 
256 aa  198  9e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2010  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.83 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0417  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.81 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.23 
 
 
266 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.45 
 
 
260 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.8 
 
 
280 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.26 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0393  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.21 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.3 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.91 
 
 
273 aa  195  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1399  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.87 
 
 
338 aa  195  7e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.3 
 
 
271 aa  194  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.03 
 
 
280 aa  194  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.85 
 
 
269 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.26 
 
 
263 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.54 
 
 
265 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.4 
 
 
283 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.96 
 
 
262 aa  192  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.29 
 
 
271 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.08 
 
 
268 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.67 
 
 
257 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.08 
 
 
268 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.16 
 
 
260 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.81 
 
 
269 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.7 
 
 
271 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2203  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.06 
 
 
270 aa  191  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.621704  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.68 
 
 
270 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.3 
 
 
276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.31 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.69 
 
 
268 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.44 
 
 
263 aa  189  4e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.6 
 
 
267 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2313  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.18 
 
 
294 aa  189  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.74 
 
 
263 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.48 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04650  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.78 
 
 
296 aa  188  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0706142  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.21 
 
 
289 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.79 
 
 
301 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.79 
 
 
270 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0431  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.11 
 
 
271 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.40782  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0456  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.89 
 
 
271 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.86 
 
 
287 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.03 
 
 
268 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.37 
 
 
271 aa  186  3e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.83 
 
 
298 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.48 
 
 
296 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.83 
 
 
296 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.86 
 
 
289 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.83 
 
 
296 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.93 
 
 
287 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.71 
 
 
287 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0661  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.87 
 
 
295 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.72 
 
 
291 aa  185  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.14 
 
 
296 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.14 
 
 
296 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.14 
 
 
296 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.14 
 
 
296 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.14 
 
 
296 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.14 
 
 
296 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0571  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.53 
 
 
266 aa  185  8e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.23 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.57 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.14 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.15 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.26 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1492  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.38 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.91 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.76 
 
 
270 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.36 
 
 
291 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  39.36 
 
 
291 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.36 
 
 
291 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000698602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>